有一个建设工程项目纠纷案例，在招投标文件中，约定了承包方垫资施工，但是，在施工合同中又约定了工程预付款、进度款。在施工过程中，承包方因为发包方没有按照合同约定支付进度款，承包方催告以后，按照合同约定实施了停工。造成了工期延误长达一年以上。此后，承包方起诉，请求发包方赔偿因逾期支付工程款，给承包方造成的各项停工损失费。没有想到的是，发包方就此提出了反诉，要求承包方按照合同约定支付工期延误的巨额违约金。
法庭上，承包方以施工合同文本作为发包方未能按照合同约定，支付工程进度款的证据；发包方以招投标文件作为承包方已经同意垫资施工的证据。合同文本与招投标文件的规定相互冲突，再看合同文件的解释顺序，一查，招投标文件优先于合同文本的解释顺序，应当以招投标文件的规定为准。因此，法院判决：承发包双方，已经约定了垫资施工，此约定为双方当事人真实的意思表示，不违反法律规定，双方均应遵守。现承包方以发包方未付工程进度款为由，停止施工，无合同依据及法律依据。因此，承包方应当按照逾期完工的合同约定，向发包方支付违约金。这是一个值得记取的教训。
有的施工合同中，虽然约定了工程预付款、工程进度款，但是，同时还约定了，一旦工程款未能及时到位，承包方应当按照施工计划继续施工。等等，都是变相垫资的合同条款。
所谓的软垫资，通常就是承包方先不支付人工费、材料商的材料费和机械设备费，约定工程施工到一定阶段再支付相关费用。但是，一旦施工过程中劳务方面、材料方面和机械设备方面扛不住，承包方就要有相应的补救措施，否则，必然造成工期延误，产生巨大风险。
再有，垫资施工的合同，一定要约定因为发包方的原因造成工期延误的，或者工程变更增加工程量的，发包方应当适当支付工程款。否则，很容易突破承包方在签订合同时候，对于工程垫资的风险预期，陷承包方于非常被动的局面。
垫资还必须考虑工程项目的合法性，不然有血本无归的可能性。
有的工程项目未能办理合法的用地手续，没有办理建设工程规划许可证，这样的项目绝不可以垫资。因为，工程项目违法，到时候，发包方拖欠工程款，而又不能以工程项目变卖，承包方可能面临要钱没有，要命一条的被动局面。