一般情况下，当建筑工程黑白合同都被认定为无效时，施工方与发包人是可以协商处理工程款事宜的，这样能较快较好地处理双方的纠纷。
当双方协商不成的，可以依据等法律法规，进行工程款结算：
１、该解释第二条规定，当建设工程施工合同无效，但建设工程经竣工验收合格，承包人请求参照合同约定支付工程价款的，应予支持。因此，当黑白合同都被认定为无效的，施工方已完工的建设工程经验收质量合格的，可以参照实际履行的合同约定支付工程价款。
２、根据该解释第三条规定，建设工程施工合同无效，且建设工程经竣工验收不合格的，按照以下情形分别处理：
修复后建筑工程验收合格的，发包人应该参照黑合同支付工程款，但可以要求施工方承担修复费用。
修复后建筑工程验收依然不合格的，发包人可以不支付工程款。需要注意的是，建筑工程验收不合格造成发包人损失的，施工方应承担相应的赔偿责任，但发包人有过错的，也要承担相应的责任，同时减轻施工方的责任。
上海工程律师：当黑白合同无效，施工方与发包人就工程款结算事宜协商不成的，最好委托专业建筑工程律师协助处理，积极收集证据资料及时到法院起诉，通过法律途径解决纠纷。